不用linux转录组数据分析,无参考基因组的转录组测序分析流程

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下边上干货.

1. 分析流程:

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2. 分析步骤

2.1 数据预处理,质控过程,与有参考的转录组分析一致

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2.2 UniGene拼接目的:将预处理后reads进行拼接,得到拼接结果。

原理: 应用 de Bruijn graph path 算法对reads进行denovo拼接;对

上一步的拼接结果,再用Hamilton Path算法拼接。

结果:UniGene序列,UniGene统计信息,序列长度分布图

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2.3 数据库注释

目的:对拼接得到的UniGene进行功能注释

原理:通过blast+算法将拼接得到的UniGene序列与数据库进行比对

结果:比对结果表格,物种分布统计