博客

写在前面

在微生物生态学领域，经常用的mantel检验，原理来讲，很是简单，就是一个距离矩阵的相关分析而已，但是这层窗户纸似乎存在很长时间，大家都对这个分析的原理有些忌惮，所以今天就之前的文档，来告诉大家如何理解mantel并且在一些文章中的运用做一个解释。

数据框—矩阵—距离矩阵

这三个数据类型类似，但是在R语言中是区分的，我们要做一个了解：

• 注意，距离矩阵是只有左下方一半的对角阵。

  #数据框
  data.frame()
  as.data.frame()
  # 矩阵
  matrix()
  as.matrix()
  # 距离矩阵
  dist()
  as.dist()

  mantel检验的原理
  

  mantel检验在生态中运用的十分多，尤其是在微生物群落和环境因子之间关系的检验上：

  
  。

  mantel检验是Mantel’s 在1967年提出来的，基于回归分析。

  使用相似性距离或者相异性距离矩阵来做双向检验。