pytorch list转tensor_PyTorch 常用代码段整理合集,建议收藏!

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转自:张皓

https://zhuanlan.zhihu.com/p/59205847

本文代码基于 PyTorch 1.0 版本,需要用到以下包


import collectionsimport osimport shutilimport tqdmimport numpy as npimport PIL.Imageimport torchimport torchvision



基础配置


检查 PyTorch 版本


torch.__version__               # PyTorch versiontorch.version.cuda              # Corresponding CUDA versiontorch.backends.cudnn.version()  # Corresponding cuDNN versiontorch.cuda.get_device_name(0)   # GPU type



更新 PyTorch

PyTorch 将被安装在 anaconda3/lib/python3.7/site-packages/torch/目录下。


conda update pytorch torchvision -c pytorch



固定随机种子


torch.manual_seed(0)torch.cuda.manual_seed_all(0)



指定程序运行在特定 GPU 卡上

在命令行指定环境变量


CUDA_VISIBLE_DEVICES=0,1 python train.py


或在代码中指定


os.environ[ CUDA_VISIBLE_DEVICES ] =  0,1


判断是否有 CUDA 支持


torch.cuda.is_available()



设置为 cuDNN benchmark 模式

Benchmark 模式会提升计算速度,但是由于计算中有随机性,每次网络前馈结果略有差异。


torch.backends.cudnn.benchmark = True


如果想要避免这种结果波动,设置


torch.backends.cudnn.deterministic = True



清除 GPU 存储

有时 Control-C 中止运行后 GPU 存储没有及时释放,需要手动清空。在 PyTorch 内部可以


torch.cuda.empty_cache()


或在命令行可以先使用 ps 找到程序的 PID,再使用 kill 结束该进程


ps aux | grep pythonkill -9 [pid]


或者直接重置没有被清空的 GPU


nvidia-smi --gpu-reset -i [gpu_id]



张量处理


张量基本信息


tensor.type()   # Data type

tensor.size()   # Shape of the tensor. It is a subclass of Python tuple

tensor.dim()    # Number of dimensions.



数据类型转换


# Set default tensor type. Float in PyTorch is much faster than double.

torch.set_default_tensor_type(torch.FloatTensor)# Type convertions.

tensor = tensor.cuda()

tensor = tensor.cpu()

tensor = tensor.float()

tensor = tensor.long()



torch.Tensor 与 np.ndarray 转换


# torch.Tensor -> np.ndarray.

ndarray = tensor.cpu().numpy()# np.ndarray -> torch.Tensor.

tensor = torch.from_numpy(ndarray).float()

tensor = torch.from_numpy(ndarray.copy()).float()  # If ndarray has negative stride



torch.Tensor 与 PIL.Image 转换

PyTorch 中的张量默认采用 N×D×H×W 的顺序,并且数据范围在 [0, 1],需要进行转置和规范化。


# torch.Tensor -> PIL.Image.

image = PIL.Image.fromarray(torch.clamp(tensor * 255, min=0, max=255

).byte().permute(1, 2, 0).cpu().numpy())

image = torchvision.transforms.functional.to_pil_image(tensor)  # Equivalently way# PIL.Image -> torch.Tensor.

tensor = torch.from_numpy(np.asarray(PIL.Image.open(path))

).permute(2, 0, 1).float() / 255

tensor = torchvision.transforms.functional.to_tensor(PIL.Image.open(path))  # Equivalently way



np.ndarray 与 PIL.Image 转换


# np.ndarray -> PIL.Image.image = PIL.Image.fromarray(ndarray.astypde(np.uint8))# PIL.Image -> np.ndarray.ndarray = np.asarray(PIL.Image.open(path))



从只包含一个元素的张量中提取值

这在训练时统计 loss 的变化过程中特别有用。否则这将累积计算图,使 GPU 存储占用量越来越大。


value = tensor.item()



张量形变

张量形变常常需要用于将卷积层特征输入全连接层的情形。相比 torch.view,torch.reshape 可以自动处理输入张量不连续的情况。


tensor = torch.reshape(tensor, shape)



打乱顺序


tensor = tensor[torch.randperm(tensor.size(0))]  # Shuffle the first dimension



水平翻转

PyTorch 不支持 tensor[::-1] 这样的负步长操作,水平翻转可以用张量索引实现。


# Assume tensor has shape N*D*H*W.tensor = tensor[:, :, :, torch.arange(tensor.size(3) - 1, -1, -1).long()]



复制张量

有三种复制的方式,对应不同的需求。


# Operation                 |  New/Shared memory | Still in computation graph |

tensor.clone()            # |        New         |          Yes               |

tensor.detach()           # |      Shared        |          No                |

tensor.detach.clone()()   # |        New         |          No                |



拼接张量

注意 torch.cat 和 torch.stack 的区别在于 torch.cat 沿着给定的维度拼接,而 torch.stack 会新增一维。例如当参数是 3 个 10×5 的张量,torch.cat 的结果是 30×5 的张量,而 torch.stack 的结果是 3×10×5 的张量。


tensor = torch.cat(list_of_tensors, dim=0)tensor = torch.stack(list_of_tensors, dim=0)



将整数标记转换成独热(one-hot)编码

PyTorch 中的标记默认从 0 开始。


N = tensor.size(0)

one_hot = torch.zeros(N, num_classes).long()

one_hot.scatter_(dim=1, index=torch.unsqueeze(tensor, dim=1), src=torch.ones(N, num_classes).long())



得到非零/零元素


torch.nonzero(tensor)               # Index of non-zero elements

torch.nonzero(tensor == 0)          # Index of zero elements

torch.nonzero(tensor).size(0)       # Number of non-zero elements

torch.nonzero(tensor == 0).size(0)  # Number of zero elements



张量扩展


# Expand tensor of shape 64*512 to shape 64*512*7*7.torch.reshape(tensor, (64, 512, 1, 1)).expand(64, 512, 7, 7)



矩阵乘法


# Matrix multiplication: (m*n) * (n*p) -> (m*p).result = torch.mm(tensor1, tensor2)# Batch matrix multiplication: (b*m*n) * (b*n*p) -> (b*m*p).result = torch.bmm(tensor1, tensor2)# Element-wise multiplication.result = tensor1 * tensor2



计算两组数据之间的两两欧式距离


# X1 is of shape m*d.X1 = torch.unsqueeze(X1, dim=1).expand(m, n, d)# X2 is of shape n*d.X2 = torch.unsqueeze(X2, dim=0).expand(m, n, d)# dist is of shape m*n, where dist[i][j] = sqrt(|X1[i, :] - X[j, :]|^2)dist = torch.sqrt(torch.sum((X1 - X2) ** 2, dim=2))



模型定义


卷积层

最常用的卷积层配置是


conv = torch.nn.Conv2d(in_channels, out_channels, kernel_size=3, stride=1, padding=1, bias=True)conv = torch.nn.Conv2d(in_channels, out_channels, kernel_size=1, stride=1, padding=0, bias=True)


如果卷积层配置比较复杂,不方便计算输出大小时,可以利用如下可视化工具辅助

链接:https://ezyang.github.io/convolution-visualizer/index.html


0GAP(Global average pooling)层


gap = torch.nn.AdaptiveAvgPool2d(output_size=1)



双线性汇合(bilinear pooling)


X = torch.reshape(N, D, H * W)                        # Assume X has shape N*D*H*W

X = torch.bmm(X, torch.transpose(X, 1, 2)) / (H * W)  # Bilinear pooling

assert X.size() == (N, D, D)

X = torch.reshape(X, (N, D * D))

X = torch.sign(X) * torch.sqrt(torch.abs(X) + 1e-5)   # Signed-sqrt normalization

X = torch.nn.functional.normalize(X)                  # L2 normalization



多卡同步 BN(Batch normalization)

当使用 torch.nn.DataParallel 将代码运行在多张 GPU 卡上时,PyTorch 的 BN 层默认操作是各卡上数据独立地计算均值和标准差,同步 BN 使用所有卡上的数据一起计算 BN 层的均值和标准差,缓解了当批量大小(batch size)比较小时对均值和标准差估计不准的情况,是在目标检测等任务中一个有效的提升性能的技巧。

链接:https://github.com/vacancy/Synchronized-BatchNorm-PyTorch


类似 BN 滑动平均

如果要实现类似 BN 滑动平均的操作,在 forward 函数中要使用原地(inplace)操作给滑动平均赋值。


class BN(torch.nn.Module)def __init__(self):

...self.register_buffer( running_mean , torch.zeros(num_features))def forward(self, X):

...self.running_mean += momentum * (current - self.running_mean)



计算模型整体参数量


num_parameters = sum(torch.numel(parameter) for parameter in model.parameters())



类似 Keras 的 model.summary() 输出模型信息

链接:https://github.com/sksq96/pytorch-summary


模型权值初始化

注意 model.modules() 和 model.children() 的区别:model.modules() 会迭代地遍历模型的所有子层,而 model.children() 只会遍历模型下的一层。


# Common practise for initialization.for layer in model.modules():if isinstance(layer, torch.nn.Conv2d):

torch.nn.init.kaiming_normal_(layer.weight, mode= fan_out ,

nonlinearity= relu )if layer.bias is not None:

torch.nn.init.constant_(layer.bias, val=0.0)elif isinstance(layer, torch.nn.BatchNorm2d):

torch.nn.init.constant_(layer.weight, val=1.0)

torch.nn.init.constant_(layer.bias, val=0.0)elif isinstance(layer, torch.nn.Linear):

torch.nn.init.xavier_normal_(layer.weight)if layer.bias is not None:

torch.nn.init.constant_(layer.bias, val=0.0)# Initialization with given tensor.

layer.weight = torch.nn.Parameter(tensor)



部分层使用预训练模型

注意如果保存的模型是 torch.nn.DataParallel,则当前的模型也需要是


model.load_state_dict(torch.load( model,pth ), strict=False)



将在 GPU 保存的模型加载到 CPU


model.load_state_dict(torch.load( model,pth , map_location= cpu ))



数据准备、特征提取与微调


得到视频数据基本信息


import cv2

video = cv2.VideoCapture(mp4_path)

height = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FRAME_HEIGHT))

width = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FRAME_WIDTH))

num_frames = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FRAME_COUNT))

fps = int(video.get(cv2.CAP_PROP_FPS))

video.release()



TSN 每段(segment)采样一帧视频


K = self._num_segmentsif is_train:if num_frames > K:# Random index for each segment.

frame_indices = torch.randint(

high=num_frames // K, size=(K,), dtype=torch.long)

frame_indices += num_frames // K * torch.arange(K)else:

frame_indices = torch.randint(

high=num_frames, size=(K - num_frames,), dtype=torch.long)

frame_indices = torch.sort(torch.cat((

torch.arange(num_frames), frame_indices)))[0]else:if num_frames > K:# Middle index for each segment.

frame_indices = num_frames / K // 2

frame_indices += num_frames // K * torch.arange(K)else:

frame_indices = torch.sort(torch.cat((

torch.arange(num_frames), torch.arange(K - num_frames))))[0]

assert frame_indices.size() == (K,)return [frame_indices[i] for i in range(K)]



提取 ImageNet 预训练模型某层的卷积特征


# VGG-16 relu5-3 feature.

model = torchvision.models.vgg16(pretrained=True).features[:-1]# VGG-16 pool5 feature.

model = torchvision.models.vgg16(pretrained=True).features# VGG-16 fc7 feature.

model = torchvision.models.vgg16(pretrained=True)

model.classifier = torch.nn.Sequential(*list(model.classifier.children())[:-3])# ResNet GAP feature.

model = torchvision.models.resnet18(pretrained=True)

model = torch.nn.Sequential(collections.OrderedDict(

list(model.named_children())[:-1]))

with torch.no_grad():

model.eval()

conv_representation = model(image)



提取 ImageNet 预训练模型多层的卷积特征


class FeatureExtractor(torch.nn.Module):"""Helper class to extract several convolution features from the given

pre-trained model.

Attributes:

_model, torch.nn.Module.

_layers_to_extract, list or set

Example:

>>> model = torchvision.models.resnet152(pretrained=True)

>>> model = torch.nn.Sequential(collections.OrderedDict(

list(model.named_children())[:-1]))

>>> conv_representation = FeatureExtractor(

pretrained_model=model,

layers_to_extract={ layer1 ,  layer2 ,  layer3 ,  layer4 })(image)

"""def __init__(self, pretrained_model, layers_to_extract):

torch.nn.Module.__init__(self)

self._model = pretrained_model

self._model.eval()

self._layers_to_extract = set(layers_to_extract)def forward(self, x):with torch.no_grad():

conv_representation = []for name, layer in self._model.named_children():

x = layer(x)if name in self._layers_to_extract:

conv_representation.append(x)return conv_representation



其他预训练模型

链接:https://github.com/Cadene/pretrained-models.pytorch


微调全连接层


model = torchvision.models.resnet18(pretrained=True)

for param in model.parameters():

param.requires_grad = False

model.fc = nn.Linear(512, 100)  # Replace the last fc layer

optimizer = torch.optim.SGD(model.fc.parameters(), lr=1e-2, momentum=0.9, weight_decay=1e-4)



以较大学习率微调全连接层,较小学习率微调卷积层


model = torchvision.models.resnet18(pretrained=True)

finetuned_parameters = list(map(id, model.fc.parameters()))

conv_parameters = (p for p in model.parameters() if id(p) not in finetuned_parameters)

parameters = [{ params : conv_parameters,  lr : 1e-3},

{ params : model.fc.parameters()}]

optimizer = torch.optim.SGD(parameters, lr=1e-2, momentum=0.9, weight_decay=1e-4)



模型训练


常用训练和验证数据预处理

其中 ToTensor 操作会将 PIL.Image 或形状为 H×W×D,数值范围为 [0, 255] 的 np.ndarray 转换为形状为 D×H×W,数值范围为 [0.0, 1.0] 的 torch.Tensor。


train_transform = torchvision.transforms.Compose([

torchvision.transforms.RandomResizedCrop(size=224,

scale=(0.08, 1.0)),

torchvision.transforms.RandomHorizontalFlip(),

torchvision.transforms.ToTensor(),

torchvision.transforms.Normalize(mean=(0.485, 0.456, 0.406),std=(0.229, 0.224, 0.225)),

])

val_transform = torchvision.transforms.Compose([

torchvision.transforms.Resize(224),

torchvision.transforms.CenterCrop(224),

torchvision.transforms.ToTensor(),

torchvision.transforms.Normalize(mean=(0.485, 0.456, 0.406),std=(0.229, 0.224, 0.225)),

])



训练基本代码框架


for t in epoch(80):for images, labels in tqdm.tqdm(train_loader, desc= Epoch %3d  % (t + 1)):

images, labels = images.cuda(), labels.cuda()

scores = model(images)

loss = loss_function(scores, labels)

optimizer.zero_grad()

loss.backward()

optimizer.step()



标记平滑(label smoothing)


for images, labels in train_loader:

images, labels = images.cuda(), labels.cuda()

N = labels.size(0)# C is the number of classes.

smoothed_labels = torch.full(size=(N, C), fill_value=0.1 / (C - 1)).cuda()

smoothed_labels.scatter_(dim=1, index=torch.unsqueeze(labels, dim=1), value=0.9)

score = model(images)

log_prob = torch.nn.functional.log_softmax(score, dim=1)

loss = -torch.sum(log_prob * smoothed_labels) / N

optimizer.zero_grad()

loss.backward()

optimizer.step()



Mixup


beta_distribution = torch.distributions.beta.Beta(alpha, alpha)for images, labels in train_loader:

images, labels = images.cuda(), labels.cuda()# Mixup images.

lambda_ = beta_distribution.sample([]).item()index = torch.randperm(images.size(0)).cuda()

mixed_images = lambda_ * images + (1 - lambda_) * images[index, :]# Mixup loss.

scores = model(mixed_images)

loss = (lambda_ * loss_function(scores, labels)

+ (1 - lambda_) * loss_function(scores, labels[index]))

optimizer.zero_grad()

loss.backward()

optimizer.step()



L1 正则化


l1_regularization = torch.nn.L1Loss(reduction= sum )

loss = ...  # Standard cross-entropy loss

for param in model.parameters():

loss += torch.sum(torch.abs(param))

loss.backward()



不对偏置项进行 L2 正则化/权值衰减(weight decay)


bias_list = (param for name, param in model.named_parameters() if name[-4:] ==  bias )

others_list = (param for name, param in model.named_parameters() if name[-4:] !=  bias )

parameters = [{ parameters : bias_list,  weight_decay : 0},                { parameters : others_list}]

optimizer = torch.optim.SGD(parameters, lr=1e-2, momentum=0.9, weight_decay=1e-4)



梯度裁剪(gradient clipping)


torch.nn.utils.clip_grad_norm_(model.parameters(), max_norm=20)



计算 Softmax 输出的准确率


score = model(images)prediction = torch.argmax(score, dim=1)num_correct = torch.sum(prediction == labels).item()accuruacy = num_correct / labels.size(0)



可视化模型前馈的计算图

链接:https://github.com/szagoruyko/pytorchviz


可视化学习曲线

有 Facebook 自己开发的 Visdom 和 Tensorboard 两个选择。

https://github.com/facebookresearch/visdom

https://github.com/lanpa/tensorboardX


# Example using Visdom.

vis = visdom.Visdom(env= Learning curve , use_incoming_socket=False)

assert self._visdom.check_connection()self._visdom.close()

options = collections.namedtuple( Options , [ loss ,  acc ,  lr ])(

loss={

xlabel :  Epoch ,  ylabel :  Loss ,  showlegend : True},

acc={

xlabel :  Epoch ,  ylabel :  Accuracy ,  showlegend : True},

lr={

xlabel :  Epoch ,  ylabel :  Learning rate ,  showlegend : True})for t in epoch(80):

tran(...)

val(...)

vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([train_loss]),

name= train , win= Loss , update= append , opts=options.loss)

vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([val_loss]),

name= val , win= Loss , update= append , opts=options.loss)

vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([train_acc]),

name= train , win= Accuracy , update= append , opts=options.acc)

vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([val_acc]),

name= val , win= Accuracy , update= append , opts=options.acc)

vis.line(X=torch.Tensor([t + 1]), Y=torch.Tensor([lr]),

win= Learning rate , update= append , opts=options.lr)



得到当前学习率


# If there is one global learning rate (which is the common case).

lr = next(iter(optimizer.param_groups))[ lr ]

# If there are multiple learning rates for different layers.

all_lr = []for param_group in optimizer.param_groups:

all_lr.append(param_group[ lr ])



学习率衰减


# Reduce learning rate when validation accuarcy plateau.

scheduler = torch.optim.lr_scheduler.ReduceLROnPlateau(optimizer, mode= max , patience=5, verbose=True)for t in range(0, 80):

train(...); val(...)

scheduler.step(val_acc)# Cosine annealing learning rate.

scheduler = torch.optim.lr_scheduler.CosineAnnealingLR(optimizer, T_max=80)# Reduce learning rate by 10 at given epochs.

scheduler = torch.optim.lr_scheduler.MultiStepLR(optimizer, milestones=[50, 70], gamma=0.1)for t in range(0, 80):

scheduler.step()

train(...); val(...)# Learning rate warmup by 10 epochs.

scheduler = torch.optim.lr_scheduler.LambdaLR(optimizer, lr_lambda=lambda t: t / 10)for t in range(0, 10):

scheduler.step()

train(...); val(...)



保存与加载断点

注意为了能够恢复训练,我们需要同时保存模型和优化器的状态,以及当前的训练轮数。


# Save checkpoint.

is_best = current_acc > best_acc

best_acc = max(best_acc, current_acc)

checkpoint = {

best_acc : best_acc,     epoch : t + 1, model : model.state_dict(), optimizer : optimizer.state_dict(),

}

model_path = os.path.join( model ,  checkpoint.pth.tar )

torch.save(checkpoint, model_path)if is_best:

shutil.copy( checkpoint.pth.tar , model_path)

# Load checkpoint.if resume:

model_path = os.path.join( model ,  checkpoint.pth.tar )assert os.path.isfile(model_path)

checkpoint = torch.load(model_path)

best_acc = checkpoint[ best_acc ]

start_epoch = checkpoint[ epoch ]

model.load_state_dict(checkpoint[ model ])

optimizer.load_state_dict(checkpoint[ optimizer ])print( Load checkpoint at epoch %d.  % start_epoch)



计算准确率、查准率(precision)、查全率(recall)


# data[ label ] and data[ prediction ] are groundtruth label and prediction

# for each image, respectively.

accuracy = np.mean(data[ label ] == data[ prediction ]) * 100

# Compute recision and recall for each class.for c in range(len(num_classes)):

tp = np.dot((data[ label ] == c).astype(int),

(data[ prediction ] == c).astype(int))

tp_fp = np.sum(data[ prediction ] == c)

tp_fn = np.sum(data[ label ] == c)

precision = tp / tp_fp * 100

recall = tp / tp_fn * 100



PyTorch 其他注意事项


模型定义

  • 建议有参数的层和汇合(pooling)层使用 torch.nn 模块定义,激活函数直接使用 torch.nn.functional。torch.nn 模块和 torch.nn.functional 的区别在于,torch.nn 模块在计算时底层调用了 torch.nn.functional,但 torch.nn 模块包括该层参数,还可以应对训练和测试两种网络状态。使用 torch.nn.functional 时要注意网络状态,如


def forward(self, x):

...

x = torch.nn.functional.dropout(x, p=0.5, training=self.training)


  • model(x) 前用 model.train() 和 model.eval() 切换网络状态。

  • 不需要计算梯度的代码块用 with torch.no_grad() 包含起来。model.eval() 和 torch.no_grad() 的区别在于,model.eval() 是将网络切换为测试状态,例如 BN 和随机失活(dropout)在训练和测试阶段使用不同的计算方法。torch.no_grad() 是关闭 PyTorch 张量的自动求导机制,以减少存储使用和加速计算,得到的结果无法进行 loss.backward()。

  • torch.nn.CrossEntropyLoss 的输入不需要经过 Softmax。torch.nn.CrossEntropyLoss 等价于 torch.nn.functional.log_softmax + torch.nn.NLLLoss。

  • loss.backward() 前用 optimizer.zero_grad() 清除累积梯度。optimizer.zero_grad() 和 model.zero_grad() 效果一样。


PyTorch 性能与调试

  • torch.utils.data.DataLoader 中尽量设置 pin_memory=True,对特别小的数据集如 MNIST 设置 pin_memory=False 反而更快一些。num_workers 的设置需要在实验中找到最快的取值。

  • 用 del 及时删除不用的中间变量,节约 GPU 存储。

  • 使用 inplace 操作可节约 GPU 存储,如


x = torch.nn.functional.relu(x, inplace=True)


  • 减少 CPU 和 GPU 之间的数据传输。例如如果你想知道一个 epoch 中每个 mini-batch 的 loss 和准确率,先将它们累积在 GPU 中等一个 epoch 结束之后一起传输回 CPU 会比每个 mini-batch 都进行一次 GPU 到 CPU 的传输更快。

  • 使用半精度浮点数 half() 会有一定的速度提升,具体效率依赖于 GPU 型号。需要小心数值精度过低带来的稳定性问题。

  • 时常使用 assert tensor.size() == (N, D, H, W) 作为调试手段,确保张量维度和你设想中一致。

  • 除了标记 y 外,尽量少使用一维张量,使用 n*1 的二维张量代替,可以避免一些意想不到的一维张量计算结果。

  • 统计代码各部分耗时


with torch.autograd.profiler.profile(enabled=True, use_cuda=False) as profile:

...

print(profile)


或者在命令行运行


python -m torch.utils.bottleneck main.py



致谢

感谢 @些许流年和@El tnoto的勘误。由于作者才疏学浅,更兼时间和精力所限,代码中错误之处在所难免,敬请读者批评指正。


参考资料

  • PyTorch 官方代码:pytorch/examples (https://link.zhihu.com/?target=https%3A//github.com/pytorch/examples)

  • PyTorch 论坛:PyTorch Forums (https://link.zhihu.com/?target=https%3A//discuss.pytorch.org/latest%3Forder%3Dviews)

  • PyTorch 文档:http://pytorch.org/docs/stable/index.html (https://link.zhihu.com/?target=http%3A//pytorch.org/docs/stable/index.html)

  • 其他基于 PyTorch 的公开实现代码,无法一一列举

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