一、无监督学习
无监督学习是机器学习算法中的一种。监督学习的目的主要是对数据进行分类和回归预测,它主要是通过已知推测未知,大部分监督学习算法有一个训练模型的过程;相对于监督学习,无监督学习则是主要着重于数据的分布特点,与有监督学习不同,无监督学习并没有训练的过程。
二、 聚类
针对给定的样本数据,聚类算法会根据它们的特征相似度或距离,把相似的数据划分为若干个簇中。相似的样本划分到相同的簇中, 不相似的样本划分到不同的簇。聚类处理数据的过程也是从未知到已知的过程,因为聚类算法在事先并不知道聚类得到的簇的特点和样本的分布。
k-means属于无监督学习中聚类算法的一种。
三、 k均值聚类算法
3.1 k-means
k均值聚类算法将样本集划分为k个簇,把每个样本数据划分到距离最近的簇中,且每个样本仅属于一个类,此为k均值聚类算法。k-mean算法属于硬聚类,即每个样本只能属于一个簇。
聚合聚类需要预先考虑以下几个要素:
- 距离或相似度;
- 合并规则;
- 停止条件。
3.2 步骤
-
随机选择k个簇作为
质心
(需要保证这k个簇的特征值在样本集特征值的范围之内); - 把n个样本点划分到距离最近的簇中;
- 计算每个簇的平均值。
- 判断是否收敛,如果没有收敛,则从步骤2开始。
通过图2可以了解到,由于第三张图和第四张图未发生变化,则表示此时的簇已经收敛。
3.3 实现
from numpy import *
from matplotlib import pyplot as plt
import matplotlib
def load_data_set(filename):
data_matrix = []
with open(filename) as fp:
for line in fp.readlines():
# 多个浮点型的列
data = line.strip().split('\t')
float_data = [float(datum) for datum in data]
data_matrix.append(float_data)
return data_matrix
load_data_set函数用于将文本文件导入成一个列表中。
def euclidean_distance(vec_a, vec_b):
"""计算两个向量的欧式距离"""
return sqrt(sum(power(vec_a - vec_b, 2)))
距离的计算有很多种选择,比如闵可夫斯基距离、马氏距离等,不同的距离选择会使得计算页会有所不同。这里选择的是欧氏距离,即各个特征差值的平方再开方(勾股定理的计算就用到了欧式距离),
马氏距离是欧式距离的推广
。
def random_centroids(data_set, k):
"""
返回k个随机的质心 保证这些质心随机并且不超过整个数据集的边界
:param data_set: 数据集
:param k: 质心的数量
:return: k个随机的质心
"""
# 创建一个k行n列的矩阵,用于保存随机质心
n = shape(data_set)[1]
centroids = mat(zeros((k, n)))
# 对n个特征进行遍历
for j in range(n):
minJ = min(data_set[:, j])
rangeJ = float(max(data_set[:, j]) - minJ)
centroids[:, j] = minJ + rangeJ * random.rand(k, 1)
return centroids
random_centroids的作用就是随机创建k个质心。data_set[:, j]获取的是第j列的所有元素,这种用法是numpy对
__getitem__()
即切片方法的重写。
def kMeans(data_set, k, distance_measure=euclidean_distance, create_centroids=random_centroids):
"""
k means 算法
:param data_set: 数据集
:param k: k means算法的k 即要生成几个簇
:param distance_measure: 计算距离函数
:param create_centroids: 创建质心的函数
:return:
"""
m = shape(data_set)[0]
# 向量分配到某一个(簇索引值,误差)
cluster_assment = mat(zeros((m, 2)))
# 创建k个质心
centroids = create_centroids(data_set, k)
cluster_changed = True
while cluster_changed:
cluster_changed = False
# 计算该点离哪个质心最近
for i in range(m):
min_index, min_dist = -1, inf
# 遍历k个质心 获取一个最近的质心
for j in range(k):
# 计算该点和质心j的距离
distJI = distance_measure(centroids[j, :], data_set[i, :])
if distJI < min_dist:
min_dist, min_index = distJI, j
# 分配质心索引发生了变化 则仍然需要迭代
if cluster_assment[i, 0] != min_index:
cluster_changed = True
# 不断更新最小值
cluster_assment[i, :] = min_index, min_dist ** 2
print(centroids)
# 更新质心
for cent in range(k):
# 获取属于该簇的所有点
ptsInClust = data_set[nonzero(cluster_assment[:, 0].A==cent)[0]]
# 按矩阵的列进行均值计算
centroids[cent, :] = mean(ptsInClust, axis=0)
# 显示每一次迭代后的簇的情况
# show_image(data_set, centroids, cluster_assment)
return centroids, cluster_assment
kMeans函数就是之前流程图的实现,它会迭代到簇收敛为止。
def show_image(data_set, centroids, clustAssing):
colors = 'bgrcmykb'
markers = 'osDv^p*+'
for index in range(len(clustAssing)):
datum = data_set[index]
j = int(clustAssing[index, 0])
flag = markers[j] + colors[j]
plt.plot(datum[:, 0], datum[:, 1], flag)
# 质心
plt.plot(centroids[:, 0], centroids[:, 1], '+k')
show_image函数用于点的分类的显示,它目前最多显示4个簇,过多的时候需要再sign和color上添加;除此之外,这个函数目前只能显示两个特征值,当有多个特征值的时候,可以考虑进行降维处理。
接着是主函数和数据:
if __name__ == '__main__':
data_mat = mat(load_data_set('testSet.txt'))
centroids, clustAssing = kMeans(data_mat, 4)
print('----')
# print(clustAssing)
show_image(data_mat, centroids, clustAssing)
plt.show()
数据集:
dataSet.txt
把上述数据保存为dataSet.txt和之前的kMeans.py放入同一文件夹下运行即可得到图 2所示的收敛图。
3.4 sklearn实现
python有着完整的机器学习的库,通过调用这些库,可以在很大程度上减少代码的编写和错误率。
"""
使用sklearn提供的K均值聚类算法
"""
import numpy
from sklearn.cluster import KMeans
import matplotlib.pyplot as plt
from kMeans import load_data_set
def show_image(data_set, centroids, cluster_centers):
colors = 'bgrcmykb'
markers = 'osDv^p*+'
for index in range(len(cluster_centers)):
datum = data_set[index]
j = int(cluster_centers[index])
flag = markers[j] + colors[j]
plt.plot(datum[:, 0], datum[:, 1], flag)
# 质心
plt.plot(centroids[:, 0], centroids[:, 1], '+k')
if __name__ == '__main__':
data_set = numpy.mat(load_data_set('testSet.txt'))
kmeans_model = KMeans(n_clusters=4).fit(data_set)
# 显示模型
show_image(data_set, kmeans_model.cluster_centers_, kmeans_model.labels_)
plt.show()
运行结果如下:
四、二分K-均值算法
把数据集切换为
dataSet2.txt
后,再次运行之前的kMeans算法可能会得到下图的结果:
k均值聚类算法能够保证收敛局部最优性,它的聚类效果在很大程度上依赖于随机质心的选择,这会造成算法收敛但聚类效果却较为一般。二分K-均值算法可以避免此类问题。
一种用于度量聚类效果的指标是SSE(Sum of Square Error, 误差平方和),它等于所有的样本点到对应的簇的距离的平方的和,也就是上面的kMeans函数内部cluster_assment的第一列的和(用代码实现就是sum(cluster_assment[:, 1]))。SSE越小表示数据点越接近于它们的质心,聚类效果也就越好。
4.1 思路
该算法首先将所有的样本点作为一个簇,然后将该簇一分为二;之后选择其中一个可以在最大程度上降低SSE值的簇进行划分,直到满足停止条件为止。这里的停止条件是划分的簇的数量达到了k后则停止划分。
- 把所有的点作为一个簇;
- 判断当前簇的数量是否大于等于k,如果是则直接退出,否则向下执行;
- 对于每一个簇,在给定的簇上进行K-均值聚类(k=2),并计算将该簇一分为二之后的总误差;
- 选择使得误差最小的那个簇进行划分操作;跳转到步骤2。
4.2 代码实现
def binary_kmeans(data_set, k, distance_measure=euclidean_distance):
"""
二分 K-均值算法
:param data_set: 样本集
:param k: 要划分的簇的数量
:param distance_measure: 距离计算函数
:return: 返回同kMeans()函数
"""
m = shape(data_set)[0]
cluster_assment = mat(zeros((m, 2)))
# 按照列求平均数并转换成列表
centroid0 = mean(data_set, axis=0).tolist()[0]
# 划分的簇
cent_list = [centroid0]
# 计算点当前簇的误差
for j in range(m):
cluster_assment[j, 1] = distance_measure(mat(centroid0), data_set[j, :]) ** 2
# 划分的簇小于选定值时 继续划分
while len(cent_list) < k:
lowestSSE = inf
# 找到一个划分后SSE最小的簇
for i in range(len(cent_list)):
# 获取该簇的所有数据
ptsInCurrCluster = data_set[nonzero(cluster_assment[:, 0].A == i)[0], :]
# 经过划分 一个簇得到编号分别为0和1的两个簇
centroidMat, splitClustAss = kMeans(ptsInCurrCluster, 2, distance_measure)
# 计算分簇之后的Sum of Square Error
sseSplit = sum(splitClustAss[:, 1])
sseNotSplit = sum(cluster_assment[nonzero(cluster_assment[:, 0].A != i)[0], 1])
print('sseSplit, and not split', sseSplit, sseNotSplit)
if sseSplit + sseNotSplit < lowestSSE:
bestCentToSplit = i
bestNewCents = centroidMat
bestClustAss = splitClustAss.copy()
lowestSSE = sseSplit + sseNotSplit
# 重新编排编号
bestClustAss[nonzero(bestClustAss[:, 0].A == 1)[0], 0] = len(cent_list)
bestClustAss[nonzero(bestClustAss[:, 0].A == 0)[0], 0] = bestCentToSplit
print('the bestCentToSplit is:', bestCentToSplit)
print('the len of bestClustAss is', len(bestClustAss))
cent_list[bestCentToSplit] = bestNewCents.tolist()[0]
cent_list.append(bestNewCents.tolist()[1])
cluster_assment[nonzero(cluster_assment[:, 0].A == bestCentToSplit)[0], :] = bestClustAss
# 显示每一次迭代后的簇的情况
show_image(data_set, mat(cent_list), cluster_assment)
return mat(cent_list), cluster_assment
在二分K-均值算法中主要有两个循环,第一重循环用于确定簇的个数,第二重循环用于选定一个能使得SSE降到最低的划分。在划分完成后,一个簇被划分成了两个簇,需要对这个簇进行一些后续的操作:编排序号(序号是由k均值聚类算法给定的)和添加到簇列表中。
二分K-均值算法可以很好地解决k均值聚类算法的问题,不过目前的k值仍然需要预先给定。
参考:
- 《机器学习实战》
- 《统计学习方法》
- 《Python 机器学习及实践》