【Linux版本】Blast工具安装

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下载文件路径

:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/

选择预编译的linux版本


下载命令

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz


对文档解压

tar -zxvf ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz


将其移至自己想要的安装目录中

mv ncbi-blast-2.2.30+ 自己的目录路径 # 移动
cd 自己的目录路径                    # 进入本地进程安装路径
mv ncbi-blast-2.2.30+ blast        # 修改目录名

需要将blast+的路径加入到环境变量中,方便以后的调取

可以用 vim 编辑器,在 ~/.bashrc文件 输入如下所示:

按 i 进入输入模式,在最后加入以下行:

export PATH=自己的路径:$PATH

按 esc 退出输入模式,进入命令模式。输入 :wq 保存并退出

使之生效

source ~/.bashrc

验证

blastn -version



参考文献


[1]Linux下BLAST的安装与使用



[2]Linux安装blast+及使用



[3]Ubuntu 下Blast+工具的安装与环境配置



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