2012年3月22日更新：
终于找到问题的根源了，其实算是rsync的一个bug，就是如果收到过多的报告权限不足无法同步的错误后，rsync就会报IO错误跳过删除文件的操作。
要解决这个问题，要么保证不会出现权限不足无法同步的情况，要么，就还是按照我下面的方法来解决。
今天，我在服务器上发现通过rsync同步的文件有问题，在镜像服务器这边的文件没有同步删除，于是在终端手工运行了一下命令，发现有以下报错：
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IO error encountered — skipping file deletion
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看样子是提示IO错误，因此跳过了文件删除选项。于是赶忙到服务器上检查是否真的存在IO错误，结果答案是，根本就没有IO问题，主服务器和镜像服务器的对应文件夹下创建和删除文件，都没问题。
于是仔细查看了一下rsync的参数，发现有一个选项是：
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–ignore-errors 即使出现 I/O 错误也进行删除
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于是加上了这个参数，再次执行同步，问题解决了。
但是至于为什么rsync会误报这个错误，目前我还没有找到原因，如果有哪一位知道的话，欢迎解惑。
下面，顺便附上rsync的常用参数选项，方便大家参考：
选项
说明
-a, –archive
归档模式，表示以递归方式传输文件，并保持所有文件属性，等价于 -rlptgoD (不包括 -H)